故事發(fā)生在虛構(gòu)的未來(lái)世界，彼時(shí)，人類(lèi)因?yàn)槭韬龊痛笠舛チ酥坪?quán)，海洋，成為了人們可望而不可即的所在，盤(pán)踞在那里的，是一股名為“深海棲艦”的強(qiáng)大勢(shì)力。為了同這股勢(shì)力抗?fàn)?，一群名為“艦?zāi)铩钡呐⒆觽兂霈F(xiàn)了，在她們的體內(nèi)，棲息著艦艇之魂，亦是明日呢化身成為各式各樣的戰(zhàn)艦，為了人類(lèi)的和平做著不懈的努力。
平日里，艦?zāi)飩冊(cè)诿麨椤版?zhèn)守府”的大本營(yíng)里進(jìn)行日常生活和訓(xùn)練，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活潑女孩出現(xiàn)在了大家的面前，初來(lái)乍到的她躊躇滿志，熱情滿滿地加入了艦隊(duì)的新生活中去，在這里，充滿了精彩和刺激的日常就此展開(kāi)。
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