創(chuàng)圣紀(jì)0011年的地球，由于11年前的大異變，人類喪失了2/3的人口。
南極冰山溶化，1萬2千年前滅亡的亞特蘭蒂亞重現(xiàn)于世，擁有雙翼的「墮天翅族」蘇醒了。他們將生物機械兵器「神話獸」接連送入人類的都市，捕獲人類，攝取生體能源「Purana」。
另一方面，人類決心反擊，從海底遺跡發(fā)掘?qū)缛_組合（hybrid）戰(zhàn)斗機「Vector Machine」。這是1萬2千年前，將墮天翅族逼入滅亡絕境的傳說中的兵器。Vector Machine經(jīng)過合體，「機械天使Aquarion」即將現(xiàn)身。
要啟動Aquarion，需要能與機體的機械生命感應(yīng)和共鳴，稱為「Element」的人。這要求特別敏銳的五感和純真的靈魂，因此十五歲左右的少年少女們被選為機師，集中起來。
而后，「機械天使Aquarion」合體的時刻終于到來…
石田彰 豐口惠美 鳥海浩輔 田中理惠 綠川光 能登麻美子 田之中勇 澤城美雪 中井和哉 堀秀行 野島健兒 種崎敦美 三浦祥朗 小松由佳 市道真央 小巖井小鳥 Lynn 石谷春貴 大久?，娒?nbsp;三宅麻理惠 櫻川惠 高橋伸也
岡咲美保 古川慎 千本木彩花 市道真央 江口拓也 大塚芳忠 柳田淳一 山本兼平 泊明日菜 小林親弘 山口太郎 福島潤 大久?，娒?nbsp;田中理惠
島崎信長 鈴木達央 宮野真守 內(nèi)山昂輝 豐永利行 木村良平 細(xì)谷佳正 野島健兒 日野聰 代永翼 平川大輔 宮田幸季 鈴村健一 鈴木千尋 渡邊明乃 阿部敦 松岡禎丞 廣橋涼 津田健次郎 木內(nèi)秀信