在太一一行人告別數(shù)碼世界后，數(shù)碼世界并沒有就此關(guān)閉朝向人類的大門，而數(shù)碼世界的內(nèi)部卻沒有太平多少時日，就又開始了紛爭。
數(shù)碼世界急需一批被選中的孩子來維護(hù)數(shù)碼世界和人類世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成為了初中生，沒有太多精力和時間能夠和數(shù)碼寶貝們一起并肩作戰(zhàn)，只有阿武和小光成為了新一代的領(lǐng)頭人。被選中的孩子有本宮大輔（木內(nèi)玲子 配音）、井之上京（夏樹莉緒 配音）、火田伊織（夏樹惠 配音）等人，和他們一同戰(zhàn)斗的除了亞古獸、加布獸等，還有新的數(shù)碼寶貝參與。于是，在第一代數(shù)碼人的帶領(lǐng)下，新的數(shù)碼寶貝和守護(hù)者們開始了同邪惡勢力的作戰(zhàn)……
中村悠一 江口拓也 三木真一郎 松岡禎丞 染谷俊之 佐藤拓也 代永翼 多田啟太 鈴木達(dá)央 八代拓 武內(nèi)駿輔 中島良樹 真堂圭 山下七海 木下浩之 大浦冬華 羽多野涉