故事旁白從雷克斯·路瑟開(kāi)始，描述超人所作的英雄事跡及形象。雷克斯描述超人作為一個(gè)地球上的神，但堅(jiān)持說(shuō)“該來(lái)的時(shí)候，甚至是神也必須要死”。
　　露易絲·蓮恩和超人正在浪漫的約會(huì)，但露意絲對(duì)他們的關(guān)系安排并不滿(mǎn)意。超人堅(jiān)持認(rèn)為，兩人的關(guān)系只能隱密地在孤獨(dú)堡壘中度過(guò)。他還沒(méi)有向他透露自己真實(shí)身份是克拉克·肯特，盡管露意絲已經(jīng)開(kāi)始懷疑。
　　另一方面雷克斯公司挖掘到一艘太空船，當(dāng)工人正在執(zhí)行挖掘的工作時(shí)不小心將基因改造的兇殘怪物末日殺手釋放。末日殺手將工人們?nèi)珨?shù)殺害后一步步走到了都市，一路上將鹿、狗、狗的主人全都?xì)⑺?。橫沖直撞的末日殺手到達(dá)大都市后隨即被超人發(fā)現(xiàn)，兩人并展開(kāi)大戰(zhàn)。最后超人全力抓著它從高空直落撞擊地面，露易絲與同事吉米·奧爾森告訴受重傷的超人已成功打倒敵人，但超人也因受傷過(guò)重而斷了氣。
　　世界集體哀悼他們倒下的英雄，并在公園建立了超人的紀(jì)念碑。后來(lái)雷克斯將他的女助理一槍殺死以確保再也沒(méi)人知道雷克斯公司和末日殺手的出現(xiàn)有關(guān)。后來(lái)吉米對(duì)超人的死相當(dāng)難過(guò)，意外地到了其他大間的報(bào)社上班。超人死后，犯罪率增加，玩具人操控著巨大機(jī)械蜘蛛并挾持了一輛戴滿(mǎn)小孩的校車(chē)在屋頂上，露易絲決定將人質(zhì)救出，便獨(dú)自前往，但在遇到危機(jī)時(shí)，超人意外地及時(shí)出現(xiàn)制伏了玩具人。露易絲開(kāi)心地和復(fù)活的超人一吻，后來(lái)超人的養(yǎng)母瑪莎感到質(zhì)疑為什么他沒(méi)有打電話回家，露易絲也認(rèn)為超人有點(diǎn)奇怪。
　　后來(lái)透露其實(shí)復(fù)活的超人是雷克斯制造的克隆人，雷克斯在超人與末日殺手一戰(zhàn)時(shí)采集了前者的血液，因此復(fù)制超人只聽(tīng)命于雷克斯。后來(lái)雷克斯將復(fù)制超人引到了一間有紅色太陽(yáng)光的房間，并戴上氪石的手套不斷打擊他藉以發(fā)泄。打完后雷克斯便前去看他私自挖出的超人本尊尸體。但實(shí)際上超人還活著，并偷偷地被超人的機(jī)器人助手移到孤獨(dú)堡壘中恢復(fù)。
　　復(fù)制超人在看到逃獄后的玩具人殺死了一名4歲的女孩的報(bào)導(dǎo)時(shí)，性格突然變得灰暗，即刻前去把玩具人殺掉，此作法使得周遭的人感到奇怪，警察也開(kāi)始追捕他，露易絲認(rèn)為他不是真的超人。后來(lái)露意絲和吉米發(fā)現(xiàn)了雷克斯想要復(fù)制超人大軍的計(jì)劃，在雷克斯正打算將兩人解決時(shí)，突然復(fù)制超人出面幫助了兩人且還將所有的復(fù)制超人試管全數(shù)破壞，因?yàn)閺?fù)制超人自行將自己體內(nèi)含鉛的氪石拿出使得雷克斯無(wú)法控制他。
　　另一方面真正的超人在機(jī)器人助手的幫助下漸漸恢復(fù)力量，但后來(lái)聽(tīng)到有關(guān)軍隊(duì)和復(fù)制超人開(kāi)戰(zhàn)的消息便即時(shí)前往，但因力量只恢復(fù)了六成，機(jī)器人給他穿上了黑色的太陽(yáng)超人裝并將氪石槍交給超人。后來(lái)超人便和復(fù)制超人展開(kāi)對(duì)戰(zhàn)，超人的氪石槍被打飛至遠(yuǎn)處，超人持續(xù)處于下風(fēng)，露易絲將氪石槍撿起并打算射復(fù)制超人時(shí)被對(duì)方破壞了槍?zhuān)词薜袅顺鰜?lái)。復(fù)制超人在石油地打倒超人時(shí)將一旁的紀(jì)念碑舉起打算了結(jié)對(duì)方，超人用熱力射線將黏于復(fù)制超人胸口的氪石罐打破冒出了大量的氪氣體，復(fù)制超人因此敗北。臨死前，他告訴超人要保護(hù)人民。露易絲確定了他是真正的超人并親吻了他，同時(shí)也贏得大家的信賴(lài)。
　　超人在露易絲的公寓，發(fā)現(xiàn)她的文章“復(fù)活”拼錯(cuò)，并戴上眼鏡證明自己就是克拉克，露易絲便高興地?fù)肀?。在雷克斯公司，雷克斯先前被?fù)制超人打成重傷，但仍活著敘述歷史已經(jīng)證明，神可以死，但他們還可以回到從死里復(fù)活。他對(duì)自己微笑、沉思，可能又再想要如何摧毀超人。