環(huán)境學者である西山玄學は、企業(yè)や企業(yè)の肩を持つ警察の圧力に屈することなく公害の実態(tài)調査をする一方、代々家に伝わる『諸世紀』の研究をしていた。そんな或る日、娘であるまり子の戀人の中川が帰國。まり子と中川の前で、父の西山玄學は「今の時代、先がどうなるかわからない。結婚しても子供は作るな」と殘酷な忠告をした。數日後、夢の島で合成防腐剤AF2のため巨大化したナメクジが大発生する。日本各地では奇形児が増加する一方で、亜鉛鉱山周辺では特定の能力が異常に発達した子供が現れる。中川の実家がある漁村が赤潮で全滅した夜、中川とまり子は互いに惹かれ、ついに船の上で結ばれる。
　　西山は、人類の行き過ぎた開発が人類を滅亡させるとして、必要以上の生産を止めるよう提言するが、人々の興味は生活の向上や生産の増加に向いており、逆に「ヒューマニズムの崩壊」と批判される始末。國際會議も、発展途上國の人口増加が環(huán)境破壊に拍車をかけていると主張する先進國と、先進國の資源浪費が環(huán)境破壊の原因だと反論する発展途上國が対立して紛糾する。そんな中、太平洋上の海面が凍りつき、エジプトで雪が降るなどの異常気象が発生。さらに、成層圏に滯留した放射能がニューギニアに降り注いだとの知らせが屆き、國際合同調査隊が派遣されることになった。西山の研究所からも2人の部下が派遣される。しかし合同調査隊は行方不明になり、西山や中川らによる第2次合同調査隊が派遣された。そこで彼らが目の當たりにしたのは、放射能によって巨大化した動植物や、食人鬼となり襲いかかる原住民、そして洞窟の奧で生きる屍と化した第1次調査隊隊員の姿であった。彼らに拳銃を向ける外國人隊員を制止する玄學だが、「こうするほかに何ができますか?」と反論された玄學も、自ら自分の部下を射殺するしかなかった。
　　その頃、SST事故によるオゾン層の破壊で日本列島に超紫外線が降り注ぎ、山火事やコンビナートの炎上が続発。さらに、異常気象は世界各地に拡大し、各國の穀倉地帯は軒並み全滅。暴騰する食料価格や大災害で人心は荒廃し、食料目當ての暴動や若者の退廃が進行。ついにそれによる二次災害までが発生し、東京の空はオゾン層の歪みで巨大な鏡と化した。大災害が頻発する中、西山の妻である伸枝は病に倒れ、玄學の腕に抱かれながら息を引き取る。その一方で、まり子の體には新しい命が宿っていた。
　　度重なる天変地異に、西山は國會で様々な人類滅亡のパターンを警告し地球の危機を力説、破滅への展望を展開していく。その凄慘な內容に衝撃を受けた內閣総理大臣は、政治家として大きな決斷を迫られた。その決斷とは…。