故事發(fā)生在二十一世紀初始，日本依舊籠罩在德川幕府的統(tǒng)治之下，柳生宗朗（平川大輔 配音）家中世代經(jīng)營道場，宗朗本人則肩負著成為下任當家的沉重責任。盡管身為德川家康的臣子，但宗朗對幕府的獨裁以及武應(yīng)學園塾對于反抗學生的暴力鎮(zhèn)壓感到十分不滿。他的不滿招致了飛來橫禍，不僅道場面臨關(guān)門大吉的命運，宗朗更是遭到了學生會派出的精銳部隊的追殺。
就在命懸一線之時，一位名為柳生十兵衛(wèi)（悠木碧 配音）的紅發(fā)少女突然從天而降擊退了敵方，之后，柳生義仙（水原薰 配音）、真田幸村（釘宮理惠 配音）、后藤又兵衛(wèi)（小林優(yōu) 配音）等一干武江少女接二連三的出現(xiàn)在了宗朗的身邊。
