2013年，都市NO.6。這里是一個沒有犯罪，沒有疾病，沒有戰(zhàn)爭，沒有所謂痛苦和怨恨的理想國度。一直這么認為的12歲天才少年紫苑（梶裕貴 配音）和母親住在NO.6的高級住宅區(qū)，在一個暴風(fēng)雨的夜晚邂逅了顛覆他世界觀的人——傷痕累累，有戾氣的少年老鼠（細谷佳正 配音）。對老鼠感到好奇和好感的紫苑不但沒有感到害怕還救了老鼠，結(jié)果被認為窩藏嫌疑犯，被剝奪了所有特權(quán)，繼而淪為了公園管理員。
經(jīng)歷了這場變故的紫苑對所生存的理想世界產(chǎn)生了懷疑，城市里也頻繁發(fā)生恐怖的死人事件。而這些事件和NO.6有著千絲萬縷的聯(lián)系，愈發(fā)困惑的紫苑不知自己已處在生死邊緣，在關(guān)鍵時刻，被四年不見的老鼠所救，來到了NO.6外圈的貧民區(qū)。在這里，紫苑逐漸認識到了NO.6的真相，而危險遠沒有離開他們……
