在第二次新吉恩戰(zhàn)爭(zhēng)、別名“夏亞的叛亂”終結(jié)后，地球圈取得了短暫的和平。
這之后3年，宇宙世紀(jì)0096年。在工業(yè)殖民地“工業(yè)7號(hào)”上進(jìn)行了一項(xiàng)秘密交涉。內(nèi)容為－－被認(rèn)為是地球聯(lián)邦政府暗中操控的“比斯特財(cái)團(tuán)”將把最高機(jī)密“拉普拉斯之箱”交給新吉恩的殘黨軍“袖付”。
另一方面，在安納海姆工業(yè)專(zhuān)門(mén)學(xué)校就讀的少年巴納吉·林克斯遇見(jiàn)了自稱(chēng)為奧黛麗·本的少女（實(shí)為舊吉恩公國(guó)次男多茲魯·扎比之女，美耐巴·扎比）奧黛麗為了制止新的戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)，必須組織“拉普拉斯之箱”的交易。巴納吉在數(shù)次幫助奧黛麗之后，逐漸被她所吸引。
隨后，地球聯(lián)邦察覺(jué)了這起交易，并進(jìn)行軍事介入，工業(yè)殖民地隨即化為一片火海。巴納吉和同伴一邊避難一邊尋找著奧黛麗，而出現(xiàn)在他面前的是比斯特財(cái)團(tuán)的當(dāng)家卡迪阿斯·比斯特。奄奄一息的卡迪阿斯將出生的秘密告訴了巴納吉，并且將箱之鑰匙－－“機(jī)動(dòng)戰(zhàn)士高達(dá)獨(dú)角獸”托付給他。
隨后，一場(chǎng)圍繞“拉普拉斯之箱”的戰(zhàn)爭(zhēng)開(kāi)始了……
新田日和 八木侑紀(jì) 高橋未奈美 石原夏織 小倉(cāng)唯 飯?zhí)锢锼?nbsp;鈴木愛(ài)奈 德井青空 加藤英美里 五十嵐裕美 潘惠美 諏訪彩花 三森鈴子 松田利冴 沼倉(cāng)愛(ài)美
大久?，娒?nbsp;下野纮 中村悠一 中原麻衣 增田俊樹(shù) 中島卓也 井上雄貴 大塚剛央 山谷祥生 手冢弘道 堤雪菜 小坂井祐莉繪 田丸篤志 富田美憂 二之宮愛(ài)子 大野智敬 鐮倉(cāng)有那 高坂篤志 游佐浩二 藤原啟治
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梶裕貴 石川由依 井上麻里奈 三上枝織 下野纮 小林優(yōu) 谷山紀(jì)章 細(xì)谷佳正 樸璐美 神谷浩史 子安武人 花江夏樹(shù) 佐倉(cāng)綾音 沼倉(cāng)愛(ài)美 增田俊樹(shù) 村瀬步 松風(fēng)雅也 小野賢章 榎木淳彌 渡邊明乃 齋賀光希 井上和彥 齊藤次郎 花輪英司