西暦2042年、地球上では突如現(xiàn)れた未知の巨大生物「擬態(tài)獣」と、世界各國で開発されていた巨大ロボット達(dá)との戦いが繰り広げられていた。
　　日本のスーパーロボット「ゴーダンナー」のパイロット?猿渡ゴオは後に「巨神戦爭」と呼ばれるボス擬態(tài)獣との決戦において、パートナーであり戀人でもあったミラ?アッカーマンを失ってしまう。だが、ゴオはそれと引き換えに、1人の少女の命を救っていた。その少女の名は、葵杏奈。
　　辛くも人類は戦いに勝利し、5年の歳月が流れた。しかし、世界各地ではまだ擬態(tài)獣の亜種が生き殘っており、スーパーロボット達(dá)との戦いは続いていた。17歳の高校生となった杏奈はゴオと再會して戀に落ち、いつしか2人は結(jié)婚を決意する。だが結(jié)婚式當(dāng)日、日本に擬態(tài)獣が出現(xiàn)。ゴオは式を途中で中斷し、ゴーダンナーで出撃する。
　　しかし、杏奈はただ夫の帰りを待っているだけの女の子ではなかった! 杏奈はゴーダンナーのパートナーロボット「ネオオクサー」に乗り込み、自身も擬態(tài)獣との戦いに身を投じる! 果たして、2人は無事結(jié)婚することが出來るのか!? そして、世界の平和を守ることが出來るのか!?