漆黑的夜晚，一名間諜悄然潛入日本警方某機(jī)構(gòu)，盜走了記載著各國諜報(bào)機(jī)構(gòu)重要數(shù)據(jù)的絕密文件的絕密數(shù)據(jù)。日本警方和FBI探員赤井秀一（池田秀一 配音）旋即與間諜展開追逐。最后，逃亡者的車輛墜落懸崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴們來到東都水族館觀光，結(jié)果發(fā)現(xiàn)一名受傷的美麗女子（天海佑希 配音）。該女子處于失憶狀態(tài)，身上的手機(jī)也破損無法使用。柯南等人答應(yīng)要幫她恢復(fù)記憶，當(dāng)他們七嘴八舌之際，藏在暗處的黑衣組織成員貝爾摩德（小山茉美 配音）冷冷地注視著這一切。在相處過程中，女子非凡的身手和奇怪的言行舉止讓灰原哀（林原惠美 配音）對其真實(shí)身份產(chǎn)生懷疑。
剛剛還一派祥和的水族館，沉浸在快樂之中的人們，根本會想到隨著那名神秘女子技藝的恢復(fù)，自己馬上就要被卷入黑暗組織的殺戮和混亂之中……
新田日和 八木侑紀(jì) 高橋未奈美 石原夏織 小倉唯 飯?zhí)锢锼?nbsp;鈴木愛奈 德井青空 加藤英美里 五十嵐裕美 潘惠美 諏訪彩花 三森鈴子 松田利冴 沼倉愛美
大久?，娒?nbsp;下野纮 中村悠一 中原麻衣 增田俊樹 中島卓也 井上雄貴 大塚剛央 山谷祥生 手冢弘道 堤雪菜 小坂井祐莉繪 田丸篤志 富田美憂 二之宮愛子 大野智敬 鐮倉有那 高坂篤志 游佐浩二 藤原啟治
石田彰 豐口惠美 鳥海浩輔 田中理惠 綠川光 能登麻美子 田之中勇 澤城美雪 中井和哉 堀秀行 野島健兒 種崎敦美 三浦祥朗 小松由佳 市道真央 小巖井小鳥 Lynn 石谷春貴 大久保瑠美 三宅麻理惠 櫻川惠 高橋伸也
岡咲美保 古川慎 千本木彩花 市道真央 江口拓也 大塚芳忠 柳田淳一 山本兼平 泊明日菜 小林親弘 山口太郎 福島潤 大久?，娒?nbsp;田中理惠
梶裕貴 石川由依 井上麻里奈 三上枝織 下野纮 小林優(yōu) 谷山紀(jì)章 細(xì)谷佳正 樸璐美 神谷浩史 子安武人 花江夏樹 佐倉綾音 沼倉愛美 增田俊樹 村瀬步 松風(fēng)雅也 小野賢章 榎木淳彌 渡邊明乃 齋賀光希 井上和彥 齊藤次郎 花輪英司