宇宙殖民地移民經過數百年的宇宙時代，爭奪地球圈霸權的戰(zhàn)爭結束了，本以為和平的時代已經來臨，然而卻是快要面臨著崩毀。
　　A.G.（Advanced Generation）101年
　　突如其來的不明敵人（UE=Unknown Enemy）攻擊宇宙殖民地“天使”并使其崩毀，這死傷慘重的悲劇日后被稱為“天使的日落”，之后UE對居住在地球圈的人們帶來長期的危害。
　　A.G.108年
　　與UE的戰(zhàn)斗持續(xù)著，原本和平的宇宙殖民地“奧凡”也遭到襲擊，居住在此的7歲少年弗里特·明日野在戰(zhàn)火中失去了母親。不過，母親在臨終時，將家中代代相傳的記憶單元“AGE裝置”托付給他。其中包含著被稱為救世主的古代MS“高達”的設計圖，弗利特繼承了母親的意志，決心造出高達。
　　A.G.115年
　　14歲的弗利特被宇宙殖民地“諾拉”的聯邦軍基地阿林斯頓接收。七年間，和基地的工程師們持續(xù)著研究，終于完成了高達。這部搭載了“AGE系統(tǒng)”的高達，能夠令機體自我進化。
　　然而，可怕的時刻終于來臨……
　　UE的魔爪終于逼近和平的殖民地“諾拉”。
　　如今，弗利特開動自己制造的高達，挺身而戰(zhàn)。
　　到底弗利特能戰(zhàn)勝14年間都不能戰(zhàn)勝的可怕敵人UE嗎？
　　歷經明日野家族3代人的“百年戰(zhàn)爭”由此展開……