因?yàn)橥刀愂录?jīng)處于精英組的百合根友久（岡田將生 飾）被踢到早先成立的科學(xué)搜查班（ST）擔(dān)任指揮官，通過之前的合作，雖然百合根始終未能完全接受青山翔（志田未來 飾）、結(jié)城翠（蘆名星 飾）、黑崎勇治（漥田正孝 飾）、山吹才藏（三宅弘城 飾）以及ST實(shí)際領(lǐng)導(dǎo)者赤城左門（藤原龍也 飾）這群怪人的行徑，卻也為他們自身那極度專業(yè)和見斥于周遭的氣息所感染。百合根一面盼望早日回到搜查一課，一面又打算多守護(hù)ST的各位一段時(shí)間。隨著作為后盾的三枝警官（渡部篤郎 飾）的離開和ST新任監(jiān)查松戶紫織（瀨戶朝香 飾）的到來，ST面臨生死存亡的危機(jī)。赤門漸漸走出家門，百合根則成為遏止這頭怪物不可或缺的重要存在……
　　本片根據(jù)今野敏的原作改編。