《神勇CID》乃是著墨於警務(wù)人員與黑社會(huì)的大斗法，透過故事道出正與邪、善與惡的意義。故事首先交付二十年前劉炳堅(jiān)與賈錫年運(yùn)私貨，劉炳堅(jiān)被捕，在外國服刑，留下子女三人給賈錫年撫養(yǎng)。身任沙展的劉振輝乃劉炳堅(jiān)之二子，因女友馬思敏被毒販企圖槍殺，遵致失憶，悲痛之馀，決心追查主謀。另一方面，劉振輝之同事程進(jìn)與江寶華自小青梅竹馬，但因程進(jìn)過於大男人主義，故而江寶華便轉(zhuǎn)愛劉振輝，三個(gè)本為同僚的好友，遂牽涉進(jìn)一段復(fù)雜的三角戀愛漩渦里。與此同時(shí)，賈鍚年之子賈若龍欲獨(dú)攬黑幫大權(quán)，與黑幫頭子張雄之情婦易海倫搭上關(guān)系，被張雄發(fā)現(xiàn)，含恨在心，而賈錫年知子不肖，大加責(zé)罵。
　　賈若龍?jiān)诖饲閯?shì)下，為假裝清白，遂娶了劉振輝之妹麗瓊為妻，婚后依然與易海倫私會(huì)，劉振輝不滿，常代妹出頭，引起多次沖突。賈若龍野心勃勃，要進(jìn)一步獲得黑幫勢(shì)力，便利用失意的程進(jìn)達(dá)成目的，但在最后關(guān)頭，程進(jìn)協(xié)助劉振輝，將賈若龍繩之以法；而劉振輝與江寶華的感情亦日益成熟，一對(duì)有情人終能成眷屬。