主角有馬拓也為一個(gè)無(wú)所事事的高中生，他父親是歷史學(xué)家，卻在研究時(shí)失蹤，留下他與繼母兩人相依為命。暑假時(shí)主角收到父親寄來(lái)的包裹，里面有一個(gè)羅盤和三顆水晶珠，以及一封寫著「時(shí)間是可逆的，歷史是不可逆的」云云以及一些關(guān)于平行世界概念的信，并交待主角晚上去當(dāng)?shù)赜忻牡貥?biāo)劍之岬去見(jiàn)一個(gè)人。
拓也晚上如約來(lái)到劍之岬，發(fā)現(xiàn)自己的繼母亞由美和父親研究夥伴龍藏寺幸三都在場(chǎng)。原本和藹的龍藏寺突然翻臉要有馬把收到的郵包交出來(lái)，并拔出槍來(lái)威脅他，千鈞一發(fā)之際，一道閃電落下劈在了神社的御神石上，拓也就此暈去。等拓也甦醒過(guò)來(lái)周圍已經(jīng)旁無(wú)一人，回家睡了一覺(jué)后才發(fā)現(xiàn)不對(duì)勁。繼母和龍藏寺完全不記得昨晚發(fā)生的事情，此時(shí)他才發(fā)現(xiàn)原來(lái)父親寄給他的遺物是可以讓人在平行世界自由穿梭的神奇道具，于是他為了找到父親真正的下落展開(kāi)了一系列調(diào)查。
石田彰 豐口惠美 鳥(niǎo)海浩輔 田中理惠 綠川光 能登麻美子 田之中勇 澤城美雪 中井和哉 堀秀行 野島健兒 種崎敦美 三浦祥朗 小松由佳 市道真央 小巖井小鳥(niǎo) Lynn 石谷春貴 大久?，娒?nbsp;三宅麻理惠 櫻川惠 高橋伸也
岡咲美保 古川慎 千本木彩花 市道真央 江口拓也 大塚芳忠 柳田淳一 山本兼平 泊明日菜 小林親弘 山口太郎 福島潤(rùn) 大久保瑠美 田中理惠
命運(yùn)石之門劇場(chǎng)版：負(fù)荷領(lǐng)域的既視感
宮野真守 今井麻美 花澤香菜 田村由香里 桃井晴子 小林優(yōu) 后藤沙緒里 關(guān)智一 寺杣昌紀(jì) 山本彩乃
江口拓也 早見(jiàn)沙織 種崎敦美 松田健一郎 吉野裕行 甲斐田裕子 山路和弘 小野賢章 藤原夏海 加藤英美里 佐倉(cāng)綾音
島崎信長(zhǎng) 鈴木達(dá)央 宮野真守 內(nèi)山昂輝 豐永利行 木村良平 細(xì)谷佳正 野島健兒 日野聰 代永翼 平川大輔 宮田幸季 鈴村健一 鈴木千尋 渡邊明乃 阿部敦 松岡禎丞 廣橋涼 津田健次郎 木內(nèi)秀信
庵野秀明 瀧本美織 西島秀俊 西村雅彥 史蒂夫·阿爾珀特 風(fēng)間杜夫 竹下景子 志田未來(lái) 國(guó)村隼 大竹忍 野村萬(wàn)齋